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北京電子科技學院的前身是1947年8月在河北省平山縣西柏坡開辦的中央工委青年訓練班，由中央工委直接管理。建校以來，先后經歷了張家口軍委工程學校、北京電子專科學校、北京電子科技學院等6個發展時期。

1981年，國務院批準成立北京電子專科學校，校址設在北京昌平小湯山。1983年下半年遷至海淀區永定路北3號，并正式對外公開招收大專生。

1992年，經國家教委批準，在北京電子專科學校的基礎上，建立北京電子科技學院，1993年開始招收本科生，并增設函授教育。同年，中央辦公廳決定將中南海業余大學并入北京電子科技學院。1999年2月，學院遷至豐臺新校園。同年，學院通過教育部本科教學合格性評價。

2003年，學院與西安電子科技大學聯合開展學術型碩士研究生教育。2011年，經教育部批準，學院獨立開展碩士專業學位研究生試點工作。

目前，學院已經發展成一所以工為主，理、工、管協調發展，涵蓋本科教育、研究生教育、在職干部培訓，辦學特色鮮明的普通高等學校。